今からおよそ百年以上も前。
明治30年（1897年）に、創業者である山上倉吉（やまがみ くらきち）が、現在の福岡県糸島市志摩町船越で、しょうゆの製造を始めました。
当時、山上倉吉は村人から各家の敷居をまたぐ際に念仏を唱えることやその人柄の良さから、本名の倉吉ではなく、別名「仏の伊三郎(ほとけのいさぶろう）」と呼ばれていました。
当時の船越村は北組、中組、西組の三つの区割りがあり、倉吉は北組に属していました。 ここから「仏の伊三郎さん」から「北組の仏の伊三郎さん」に、そして、湧き水に恵まれたこの地で、しょうゆ醸造の製造を行うにあたり、屋号（やごう）を村人から呼び親しまれた「北組の仏の伊三郎さん」の「北と伊」を使い「北伊醤油」となりました。

丸大豆・小麦・塩を原料として、昔ながらの製法で長期発酵熟成する天然醸造は、多くの手間と数年という時間をかけて造られます。だから、本物の醤油と言えるのです。

晩秋から冬に仕込み、四季の移り変わりに任せて自然な環境で行う醤油づくりを天然醸造法と言い、昔ながらの醤油は、一年から三年かけて麹菌など醸造に利用されている微生物（酵母・乳酸菌など）の働きだけを利用し、微生物の代謝および、つくり出す酵素によって発酵・熟成されます。

醤油の旨みを深めるには、2年くらいの熟成期間が必要なのです。

ふつうの醤油は、調味料や着色料で色や味や香りを調整しますが、 天然醸造の「純もろみしょうゆ」には、一切の添加物は使用しておりません。

醤油の醸造に使用する「仕込み水」は、醤油の“色合い”と“まろやかな味”を造り出すと共に、醤油の品質を左右する重要な原料のひとつです。
北伊醤油は、船越山が天然の濾過装置となり生み出す「湧水」に恵まれ、この天然の「湧水」を仕込み水として醤油を醸造しています。